Sample-derived cDNA guides broad host RNA depletion for in vivo pathogen transcriptomics
この論文は、逆転写された宿主 RNA をガイドとして RNase H を用いて宿主 RNA を選択的に除去する新たな手法を開発し、生体内での病原体トランスクリプトーム解析における宿主 RNA の支配的な背景ノイズを大幅に低減し、細菌 rRNA の保存を通じて微生物複製や生存状態の定量的バイオマーカーとしての利用を可能にするとともに、シーケンシング深度の大幅な削減によって生体内トランスクリプトミクスの経済的・計算論的課題を解決したことを報告しています。